MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187094	CAG	2	6	283	288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249696
2	NT_187094	CAG	2	6	313	318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249696
3	NT_187094	TTC	2	6	386	391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249696
4	NT_187094	GTT	2	6	450	455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249696
5	NT_187094	GCA	2	6	468	473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249696
6	NT_187094	GAT	2	6	475	480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249696
7	NT_187094	CGG	2	6	620	625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249696
8	NT_187094	TGG	2	6	643	648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249696
9	NT_187094	GAAACG	2	12	678	689	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	409249696
10	NT_187094	ATT	2	6	827	832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249697
11	NT_187094	AAC	2	6	848	853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249697
12	NT_187094	GCG	2	6	871	876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249697
13	NT_187094	GCTC	2	8	951	958	0 %	25 %	25 %	50 %	409249697
14	NT_187094	TCT	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249697
15	NT_187094	ACT	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249697
16	NT_187094	GCC	2	6	1028	1033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249697
17	NT_187094	T	6	6	1036	1041	0 %	100 %	0 %	0 %	409249697
18	NT_187094	GGT	2	6	1055	1060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249697
19	NT_187094	ATG	2	6	1124	1129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249697
20	NT_187094	GCT	2	6	1195	1200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249697
21	NT_187094	AT	3	6	1261	1266	50 %	50 %	0 %	0 %	409249697
22	NT_187094	ACT	2	6	1339	1344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249697
23	NT_187094	GCA	2	6	1369	1374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249697
24	NT_187094	CG	3	6	1499	1504	0 %	0 %	50 %	50 %	409249697
25	NT_187094	AAG	2	6	1509	1514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249697
26	NT_187094	CAC	2	6	1606	1611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249697
27	NT_187094	CAG	2	6	1638	1643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249697
28	NT_187094	ATGC	2	8	1646	1653	25 %	25 %	25 %	25 %	409249697
29	NT_187094	TG	3	6	1686	1691	0 %	50 %	50 %	0 %	409249697
30	NT_187094	CTATG	2	10	1752	1761	20 %	40 %	20 %	20 %	409249697
31	NT_187094	GC	3	6	1767	1772	0 %	0 %	50 %	50 %	409249697
32	NT_187094	TC	3	6	1798	1803	0 %	50 %	0 %	50 %	409249697
33	NT_187094	GC	3	6	1854	1859	0 %	0 %	50 %	50 %	409249697
34	NT_187094	ATTG	2	8	1861	1868	25 %	50 %	25 %	0 %	409249697
35	NT_187094	GGC	2	6	1976	1981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249697
36	NT_187094	GTTC	2	8	2028	2035	0 %	50 %	25 %	25 %	409249697
37	NT_187094	AAAGG	2	10	2096	2105	60 %	0 %	40 %	0 %	409249697
38	NT_187094	TCCAGC	2	12	2184	2195	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409249698
39	NT_187094	GGC	2	6	2208	2213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249698
40	NT_187094	TGC	2	6	2271	2276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249698
41	NT_187094	GA	3	6	2402	2407	50 %	0 %	50 %	0 %	409249698
42	NT_187094	AAC	2	6	2408	2413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249698
43	NT_187094	TAAT	2	8	2498	2505	50 %	50 %	0 %	0 %	409249699
44	NT_187094	GGC	2	6	2528	2533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249699
45	NT_187094	TG	3	6	2604	2609	0 %	50 %	50 %	0 %	409249699
46	NT_187094	TCCAGA	2	12	2686	2697	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409249699
47	NT_187094	GTT	2	6	2718	2723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249699
48	NT_187094	ATC	2	6	2745	2750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249699
49	NT_187094	GTC	2	6	2781	2786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249699
50	NT_187094	CAC	2	6	2802	2807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249699
51	NT_187094	GCG	2	6	2850	2855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249699
52	NT_187094	CAA	2	6	2945	2950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249699
53	NT_187094	CTTT	2	8	2960	2967	0 %	75 %	0 %	25 %	409249699
54	NT_187094	AAT	2	6	2985	2990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249699
55	NT_187094	CAG	2	6	3084	3089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249699
56	NT_187094	GCG	2	6	3113	3118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249699
57	NT_187094	GCT	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249699
58	NT_187094	TAT	2	6	3233	3238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249699
59	NT_187094	CAC	2	6	3251	3256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249699
60	NT_187094	TCA	2	6	3263	3268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249699
61	NT_187094	ATG	2	6	3292	3297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249699
62	NT_187094	ATC	2	6	3402	3407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249699
63	NT_187094	GC	3	6	3563	3568	0 %	0 %	50 %	50 %	409249699
64	NT_187094	CAG	2	6	3717	3722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249699
65	NT_187094	CAT	2	6	3761	3766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249699
66	NT_187094	ACTG	2	8	3769	3776	25 %	25 %	25 %	25 %	409249699
67	NT_187094	GTT	2	6	3803	3808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249699
68	NT_187094	TTA	2	6	3814	3819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249699
69	NT_187094	ACA	2	6	3833	3838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249699
70	NT_187094	TCA	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249700
71	NT_187094	TCG	2	6	4003	4008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249700
72	NT_187094	CAAT	2	8	4118	4125	50 %	25 %	0 %	25 %	409249700
73	NT_187094	AACCC	2	10	4148	4157	40 %	0 %	0 %	60 %	409249700
74	NT_187094	CG	4	8	4218	4225	0 %	0 %	50 %	50 %	409249700
75	NT_187094	GTA	2	6	4356	4361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249700
76	NT_187094	CCAC	2	8	4460	4467	25 %	0 %	0 %	75 %	409249700
77	NT_187094	TGG	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249700
78	NT_187094	CAG	2	6	4578	4583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249700
79	NT_187094	GGAT	2	8	4585	4592	25 %	25 %	50 %	0 %	409249700
80	NT_187094	CAG	2	6	4644	4649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249700
81	NT_187094	GC	3	6	4682	4687	0 %	0 %	50 %	50 %	409249700
82	NT_187094	GC	3	6	4734	4739	0 %	0 %	50 %	50 %	409249700
83	NT_187094	GCG	2	6	4754	4759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249700
84	NT_187094	CGA	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249700
85	NT_187094	CGC	2	6	4799	4804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249700
86	NT_187094	ACC	2	6	4849	4854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249700
87	NT_187094	GC	3	6	4868	4873	0 %	0 %	50 %	50 %	409249700
88	NT_187094	GGCCA	2	10	4924	4933	20 %	0 %	40 %	40 %	409249700
89	NT_187094	TGT	2	6	4966	4971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249700
90	NT_187094	CCA	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249700
91	NT_187094	CCT	2	6	5375	5380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249700
92	NT_187094	CGC	2	6	5393	5398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249700
93	NT_187094	GCT	2	6	5571	5576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249700
94	NT_187094	TCA	2	6	5581	5586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249700
95	NT_187094	CA	3	6	5585	5590	50 %	0 %	0 %	50 %	409249700
96	NT_187094	GCAG	2	8	5642	5649	25 %	0 %	50 %	25 %	409249700
97	NT_187094	GGCGC	2	10	5716	5725	0 %	0 %	60 %	40 %	409249700
98	NT_187094	TGA	2	6	5732	5737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249700
99	NT_187094	TCA	2	6	5738	5743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249700
100	NT_187094	CGC	2	6	5750	5755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249700
101	NT_187094	CGG	2	6	5786	5791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249700
102	NT_187094	A	6	6	5792	5797	100 %	0 %	0 %	0 %	409249700
103	NT_187094	GCA	2	6	5819	5824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249700
104	NT_187094	GC	3	6	5830	5835	0 %	0 %	50 %	50 %	409249700
105	NT_187094	GCG	2	6	5953	5958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249700
106	NT_187094	CGG	2	6	5968	5973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249700
107	NT_187094	CG	3	6	6023	6028	0 %	0 %	50 %	50 %	409249700
108	NT_187094	AGT	2	6	6040	6045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249700
109	NT_187094	CGG	2	6	6140	6145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249700
110	NT_187094	CGGGA	2	10	6183	6192	20 %	0 %	60 %	20 %	409249700
111	NT_187094	GAG	2	6	6225	6230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249700
112	NT_187094	CAG	2	6	6249	6254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249700
113	NT_187094	AAG	2	6	6282	6287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249700
114	NT_187094	TTC	2	6	6288	6293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249700
115	NT_187094	TGT	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249700
116	NT_187094	GGCCA	2	10	6433	6442	20 %	0 %	40 %	40 %	409249700
117	NT_187094	GGCG	2	8	6465	6472	0 %	0 %	75 %	25 %	409249700
118	NT_187094	CCGC	2	8	6499	6506	0 %	0 %	25 %	75 %	409249700
119	NT_187094	CAA	2	6	6507	6512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249700
120	NT_187094	CAT	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249700
121	NT_187094	CG	3	6	6534	6539	0 %	0 %	50 %	50 %	409249700
122	NT_187094	CGAT	2	8	6569	6576	25 %	25 %	25 %	25 %	409249700
123	NT_187094	GCC	2	6	6753	6758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249701
124	NT_187094	AAC	2	6	6780	6785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249701
125	NT_187094	CGG	2	6	6799	6804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249701
126	NT_187094	GAT	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249701
127	NT_187094	ATA	2	6	6945	6950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249701
128	NT_187094	GCG	2	6	6955	6960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249701
129	NT_187094	CGG	2	6	6967	6972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249701
130	NT_187094	CG	3	6	6991	6996	0 %	0 %	50 %	50 %	409249701
131	NT_187094	GCG	2	6	7072	7077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249701
132	NT_187094	CGC	2	6	7100	7105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249701
133	NT_187094	GCCG	2	8	7132	7139	0 %	0 %	50 %	50 %	409249701
134	NT_187094	CA	3	6	7219	7224	50 %	0 %	0 %	50 %	409249701
135	NT_187094	GCA	2	6	7240	7245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249701
136	NT_187094	GCG	2	6	7259	7264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249701
137	NT_187094	GC	4	8	7299	7306	0 %	0 %	50 %	50 %	409249701
138	NT_187094	CAGC	2	8	7436	7443	25 %	0 %	25 %	50 %	409249702
139	NT_187094	ACC	2	6	7485	7490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249702
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149	NT_187094	TGA	3	9	8100	8108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249703
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170	NT_187094	GGCGG	2	10	8776	8785	0 %	0 %	80 %	20 %	409249703
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176	NT_187094	CG	3	6	8963	8968	0 %	0 %	50 %	50 %	409249703
177	NT_187094	CGA	2	6	8973	8978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249703
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230	NT_187094	TCA	2	6	12459	12464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249708
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233	NT_187094	GTCG	2	8	12674	12681	0 %	25 %	50 %	25 %	409249708
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244	NT_187094	T	6	6	13373	13378	0 %	100 %	0 %	0 %	409249708
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249	NT_187094	CAG	2	6	13544	13549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249708
250	NT_187094	TCG	2	6	13554	13559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249708
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252	NT_187094	T	6	6	13773	13778	0 %	100 %	0 %	0 %	409249709
253	NT_187094	CTG	2	6	13890	13895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249709
254	NT_187094	CGGA	2	8	13914	13921	25 %	0 %	50 %	25 %	409249709
255	NT_187094	TTA	2	6	14074	14079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249709
256	NT_187094	TTA	2	6	14093	14098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249709
257	NT_187094	CGC	2	6	14122	14127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249709
258	NT_187094	GCG	2	6	14184	14189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249709
259	NT_187094	T	7	7	14211	14217	0 %	100 %	0 %	0 %	409249709
260	NT_187094	GCA	2	6	14255	14260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249709
261	NT_187094	GC	3	6	14316	14321	0 %	0 %	50 %	50 %	409249709
262	NT_187094	ATT	2	6	14407	14412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249709
263	NT_187094	GTT	2	6	14500	14505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249710
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265	NT_187094	CAT	2	6	14549	14554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249710
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384	NT_187094	T	6	6	21703	21708	0 %	100 %	0 %	0 %	409249718
385	NT_187094	TCG	2	6	21817	21822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249718
386	NT_187094	GC	3	6	21854	21859	0 %	0 %	50 %	50 %	409249718
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